Для того, чтобы удалить кеш метаданных необходимо очистить файлы в соответствующих папках. Кеш метаданных хранится в каталоге:

<Document And Settings>\<Username>\Local Settings\Application Data\1C\1Cv8<X>\<UUID информационной базы>

либо

<диск>:\Users\<UserName>\AppData\Local\1C\1cv8<X>\<UUID информационной базы>

В нем необходимо стереть подпапки Config, ConfigSave, DBNameCache, SICache

UUID информационной базы можно найти в следующем файле:
 
<Document and settings>\<Username>\Application Data\1C\1Cv8<X>\ibases.v8i

<диск>:\Users\<UserName>\AppData\Local\1C\1Cv8<X>\ibases.v8i

Либо если вы используете платформу версии не ниже 8.3 кеш метаданных можно очистить при запуске программы.

Нужно проделать следующие действия: В окне запуска 1С спозиционироваться на базе. Далее нажать кнопку "Изменить". Потом прощелкать кнопку "Далее" до последнего экрана, где будет настройка "Дополнительные параметры запуска". В это поле нужно вбить /ClearCache . Потом нажать кнопку "Готово". После чего запустить 1С.

/ClearCache

Необходимо учитывать, что при очищенном кеше запуск 1С немного замедлится.

З.Ы. В особо терминальных случаях, когда зачистка кэша не срабатывает, помогло деление на ноль всей папки 1С в папке Roaming. Честно говоря, физического смысла я не уловил, просто однажды 1С посыпала самыми разнообразными ошибками, и ситуацию исправило выпиливание этой папки. Возможно, причина в банальной кривизне профиля пользователя, не знаю. Перед этим нужно сохранить все информационные базы, т.к. все настройки сбросятся. Собсно, достаточно сохранить файл ibases.v8i из папки Roaming\1C\1CEStart